Cysteaminhydroklorid kan brukes til fremstilling av kosmetikk, tilsetningsstoff for fôr, anti-ulcerativ medisin, det kan også brukes ved fremstilling av biokjemisk reagens og komplekst middel for tunge kjøttioner. Det kan reagere med enzym fra menneskekroppen og stabilisere ytelsen når det eksisterer stråling, derfor kan den brukes til herding av strålingssyndrom og giftet av tetraetyl-bly. Det kan gjøres til tabletter eller injeksjoner.
